شناسایی سوش جدید کرونا در دانشگاه تهران/تعریف ۱۳ گروه اصلی ویروس کرونا بر حسب توالی ژنوم
8 دی 1399

شناسایی سوش جدید کرونا در دانشگاه تهران/تعریف ۱۳ گروه اصلی ویروس کرونا بر حسب توالی ژنوم

گروهی از محققان دانشگاه تهران طی دو مطالعه که بر روی توالی ویروس کرونا انجام دادند، ضمن شناسایی ۱۳ گروه اصلی و ۵۳ زیر گروه (جمعا ۶۶) از توالی این ویروس، به سوش جدیدی از این ویروس دست یافتند که شیوع بالایی در برخی کشورها دارد. به گفته محقق طرح، اینکه این سوش همان سوشی است که در انگلستان نگرانی هایی را ایجاد کرده است، باید منتظر داوری مقاله مطالعه اخیرتر بود.

گروهی از محققان دانشگاه تهران طی دو مطالعه که بر روی توالی ویروس کرونا انجام دادند، ضمن شناسایی ۱۳ گروه اصلی و ۵۳ زیر گروه (جمعا ۶۶) از توالی این ویروس، به سوش جدیدی از این ویروس دست یافتند که شیوع بالایی در برخی کشورها دارد. به گفته محقق طرح، اینکه این سوش همان سوشی است که در انگلستان نگرانی هایی را ایجاد کرده است، باید منتظر داوری مقاله مطالعه اخیرتر بود.

دکتر الهه الهی، عضو هیات علمی دانشگاه تهران در گفت‌وگو با ایسنا، با بیان اینکه گروه وی نسبتا زود پس از گزارش ویروس در چین و انتقال آن به ایران، مطالعه خود را آغاز کردند، یادآور شد: ما به عنوان پژوهشگران ایرانی تلاش کردیم که در کنار تحقیقات دیگر خودمان در حوزه ژنتیک، بر روی ویروس کرونا مطالعاتی را شروع کنیم.

وی "دکتر ایمان صفری" و "دکتر اینانلو" را از اعضای تیم تحقیقاتی این پروژه نام برد و بر تلاش و تاثیر این پژوهشگران تاکید و اظهار کرد: ما ترجیح می‌دادیم که این پروژه تحقیقاتی نمونه‌های ایران را در بر داشته باشد، اما متاسفانه در ابتدا اطلاعات ژنتیک با کیفیت در خصوص ویروس‌های آلوده کننده ایرانیان در دسترس نبود. از این رو، ما رویکرد دیگری را اتخاذ کردیم و از داده‌های توالی‌های در دسترس در پایگاه‌های اطلاعاتی استفاده کردیم.

این محقق دانشگاه تهران یادآور شد: از طریق این داده‌ها سیر تغییرات ژنوم ویروس را با گذشت زمان و در توزیع جغرافیایی در دنیا مورد مطالعه قرار دادیم.

به گفته وی، وجود چنین پایگاه‌هایی یکی از اتفاقات مهم در علم پزشکی و زیست شناسی است؛ چرا که در این پایگاه‌ها محققان اطلاعات کسب شده خود را به صورت رایگان و بدون قید به اشتراک می‌گذارند. این به نفع تمام دنیا است و بسیار بر سهولت و تسریع پژوهش کمک می‌کند.

الهی ادامه داد: ما کلیه توالی‌های سه ماه اول شروع همه گیری کرونا را از این پایگاه‌ها دریافت کردیم و آنها را با توالی مرجع (توالی‌های ویروس به دست آمده از ۵ نفر اول مبتلا شده به این کرونا در کشور چین) مقایسه کردیم.

عضو هیات علمی دانشگاه تهران با اشاره به نتایج به دست آمده، خاطر نشان کرد: در این مقایسه مشاهده کردیم که حسب توزیع این تغییرات، می‌توانیم ویروس‌ها را به گروه‌های محدودی دسته بندی کنیم. مشخصه گروه آن است که ویروس‌های هر گروه تقریبا همواره در دو یا بیش از دو جایگاه (نوکلیتید)، تغییر خاصی را در توالی دارند. ما در این پروژه برای هر گروه، نوع تغییرات ایجاد شده در توالی این ویروس را تعیین کردیم.

وی با بیان اینکه در این گروه بندی توانستیم ۱۳ گروه اصلی یا "مادر" برای توالی ویروس کرونا تعریف کنیم، اظهار کرد: در این دسته بندی‌ها، دو گروه از نظر درصد توالی‌هایی که شامل می‌شوند، بسیار مهم بودند؛ چرا که مشاهده کردیم که از حدود ۳ هزار توالی که از این ویروس در اختیار داشتیم، حدود ۲۵ درصد در یک گروه از این دسته بندی می‌گنجید، حدود ۴۵ درصد توالی‌ها در گروه دیگری و مابقی توالی‌های به دست آمده در سایر گروه‌ها قرار ‌گرفتند.

الهی، افزود: در این بررسی‌ها مشاهده کردیم که یکی از این دو گروه (گروه ۲۵ درصدی) به توالی مرجع که در چین شناسایی شده بود، مشابهت بیشتری داشت.

وی در خصوص ویژگی توالی در گروه مهم دیگر (گروه ۴۵ درصدی)، توضیح داد: این نوع ویروس ابتدا در نیمه دوم ماه فوریه در اروپا شناسایی شد و بعد از آن به سرعت در اروپا شیوع یافت و گسترش اپیدمی در اروپا، ناشی از این گروه ویروس کرونا بوده است.

الهی با اشاره به انتشار اخباری در ابتدای سال جاری شمسی مبنی بر وجود دو نوع ویروس، یادآور شد: در این خبر گفته شده بود که این ویروس شامل دو گروه است. در واقع، یک گروه همان گروه ۲۵ درصدی ما بود (با شباهت بیشتر به توالی مرجع) و گروه دوم شامل هر ویروسی که در آن گروه قرار نمی‌گرفت؛ یعنی شامل تمام ۱۲ گروه دیگر که ما تعریف کردیم.   

مجری طرح، همچنین به گفته دکتر ملک زاده معاون تحقیقات و فناوری وقت وزارت بهداشت در زمینه ایجاد سوش بد از این ویروس اشاره کرد و توضیح داد: این سوش بد دقیقا همان سوشی است که در اروپا ایجاد شد و گسترش زیادی داشت.

به گفته وی این داده‌ها در قالب مقاله‌ای منتشر و در دسترس است.

ادامه مطالعات با ۸۰ هزار توالی ویروس کرونا

الهی خاطر نشان کرد: در ادامه این مطالعات، درصدد برآمدیم که وضعیت اخیر دنیا درباره توالی‌های ایجاد شده را مورد بررسی قرار دهیم. از این رو ما مجددا از پایگاه‌های موجود، داده‌های مربوط به توالی‌ها را دریافت کردیم. نسبت به مطالعه اولی که انجام دادیم، اطلاعات بیشتری از توالی این ویروس در دسترس بود، به گونه‌ای که در مطالعات اول حدود ۳ هزار توالی با کیفیت بالا بارگذاری شده بود، ولی در مطالعه دوم به حدود ۸۰ هزار توالی دست یافتیم.

وی اضافه کرد: ما در مطالعه دوم توالی ویروس کرونا از بیمارانی را که اخیرا آلوده شده بودند استخراج و آنها را با نتایج قبلی مقایسه کردیم و نتایج به دست آمده نشان داد که شرایط به شدت تغییر یافته است.

الهی تاکید کرد: از آنجایی که این داده‌ها در حال داوری است، به بسیاری از مطالب نمی‌توانم اشاره کنم، ولی برخی از داده‌های به دست آمده نشان از تغییر این ویروس دارد، به گونه‌ای که یک گروه ویروسی، تقریبا همه جهان را فرا گرفته است. این گفته تنها نتایج تحقیقات ما نیست، بلکه گروه‌های تحقیقاتی دیگری در دنیا نیز به این داده رسیده‌اند.

عضو هیات علمی دانشگاه تهران، افزود: ولی آنچه که در مطالعه دوم مشاهده کردیم و تشخیص دادیم، این بود که زیر گروه جدیدی ایجاد شده است. همانطور که گفته شد هر گروه را با یک سری تغییر در توالی تعریف کردیم و منظور از زیر گروه، ویروس‌هایی هستند که علاوه بر تغییرات شاخص یک گروه، یک یا بیش از یک تغییر دیگر را نیز دارند.

به گفته این محقق حوزه ژنتیک دانشگاه تهران، این زیر گروه جدید شناسایی شده جزو گروه اول هستند که علاوه بر ویژگی این گروه، ویژگی‌های دیگری را نیز شامل می‌شوند.

وی با بیان اینکه در مطالعه اولیه ۱۳ گروه اصلی و ۵۳ زیر گروه از این ویروس را شناسایی و تعریف کردیم، ادامه داد: ولی در بررسی اخیر به زیر گروهی پی بردیم که در مطالعات اول آن را تشخیص نداده بودیم و از سوی دیگر مشاهده کردیم که سوش جدید شناسایی شده بسیار سریع در برخی از کشورها شیوع می‌یابد. زمانی که نتایج مربوط به این مطالعه دوم را ارسال کردیم، دو واکسن "فایزر" و "مدرنا" آماده برای فاز بالینی می‌شدند، اما اخبار حضور سوش جدید کرونا ویروس با شیوع بالا در انگلستان منتشر نشده بود. ما امیدواریم مطالعه ما و دیگران بتواند نقش موثری در برطرف شدن شیوع این ویروس داشته باشد.

عضو هیات علمی دانشگاه تهران در پاسخ به این سوال که آیا سوش جدید شناسایی شده در این مطالعات همان سوش ویروس شیوع یافته در انگلستان بوده است، گفت: ما نمی‌توانیم بگوییم که این سوش جدید است، بلکه ما در این تحقیقات سوشی را شناسایی کردیم که در انگلستان شایع شده و اینکه بخواهیم ادعا کنیم که این سوش جدید شناسایی شده همان سوشی است که در حال حاضر در کشور انگلستان شیوع زیادی یافته و نگرانی‌هایی را ایجاد کرده است، فکر می‌کنم باید تا زمان داوری رسمی مقاله منتظر بمانیم.

شیوع بالا در برخی از کشورها

این محقق دانشگاه تهران در خصوص این سوال که چرا برخی از سوش‌ها در برخی از کشورها شیوع بالاتری دارد، توضیح داد: این مربوط می‌شود به این که یک سوش جدید در چه زمانی و در کدام منطقه جغرافیایی پدیده آمده است و ارتباط فرد آلوده شده به سوش جدید با افراد کدام کشور بیشتر است. نمونه بارز آن سوشی است که شیوع بالا در اروپا داشته است. این سوش در یکی از شهرهای ایتالیا پدید آمد و اولین افرادی که به این سوش کرونا ویروس مبتلا شدند، بیماران این کشور بودند و بعد، افراد سایر کشورهای اروپا به این سوش آلوده شدند. به عبارت دیگر یک ایتالیایی بیشتر احتمال دارد یک اروپایی را آلوده کند تا یک ایرانی. البته اتفاقات تصادفی نیز رخ می‌دهد-  همان اتفاقی که برای ایران رخ داد. این ویروس احتمالا از کشور چین آغاز شد و سپس نسبتا سریع به ایران منتقل شد. از این رو زنجیره ارتباطات بسیار مهم است.

وی در پایان یادی از دکتر قاسمی نژاد از همکاران و محققان برجسته دانشگاه تهران کرد که به دلیل کرونا فوت کردند و ابراز امیدواری کرد که به زودی این گرفتاری در ایران و دنیا برطرف شود.

    • منبع :

    اخبار مرتبط

    بیانیه بسیج ۱۹ دانشگاه علوم‌پزشکی | کاملا روشن است که نباید به واکسن آمریکا اعتماد کنیم

    24 دی 1399
    بیانیه بسیج ۱۹ دانشگاه علوم‌پزشکی | کاملا روشن است که نباید به واکسن آمریکا اعتماد کنیم

    ممنوعیت اعطای واکسن کرونا به اسرای فلسطینی در بند رژیم صهیونیستی

    24 دی 1399
    ممنوعیت اعطای واکسن کرونا به اسرای فلسطینی در بند رژیم صهیونیستی

    دیپلمات صهیونیست: اجباری برای ارائه واکسن کرونا به فلسطینی‌ها نداریم

    24 دی 1399
    دیپلمات صهیونیست: اجباری برای ارائه واکسن کرونا به فلسطینی‌ها نداریم

    تحریم دارو، واکسن کرونا و اتهام سیاسی‌کاری به ایران؛ پرتقال‌فروش کیست؟

    24 دی 1399
    تحریم دارو، واکسن کرونا و اتهام سیاسی‌کاری به ایران؛ پرتقال‌فروش کیست؟

    دعوت کانون دانشگاهیان از آیت‌الله رئیسی برای حضور در انتخابات ۱۴۰۰

    22 دی 1399
    دعوت کانون دانشگاهیان از آیت‌الله رئیسی برای حضور در انتخابات ۱۴۰۰

    مثبت شدن تست کرونای 380 نفر در استان هوبه چین

    22 دی 1399
    مثبت شدن تست کرونای 380 نفر در استان هوبه چین

    جانز هاپکینز: شمار تلفات کرونا در آمریکا به 374 هزار نفر رسید

    22 دی 1399
    جانز هاپکینز: شمار تلفات کرونا در آمریکا به 374 هزار نفر رسید

    آدرس غلط دولت به مردم درباره رفع مشکلات و لغو تحریم‌ها با مذاکره با بایدن

    21 دی 1399
    آدرس غلط دولت به مردم درباره رفع مشکلات و لغو تحریم‌ها با مذاکره با بایدن

    رفع منع تردد بین‌شهری در شهرهای آبی و زرد/ کلیات سند ملی واکسیناسیون تصویب شد

    20 دی 1399
    رفع منع تردد بین‌شهری در شهرهای آبی و زرد/ کلیات سند ملی واکسیناسیون تصویب شد

    شهریاری: چگونه می‌توان به واکسن‌ کشورهایی که به ما دارو نمی‌دهند اعتماد کرد

    20 دی 1399
    شهریاری: چگونه می‌توان به واکسن‌ کشورهایی که به ما دارو نمی‌دهند اعتماد کرد

    روحانی: وزارت بهداشت به‌ درستی درخواست خارجی‌ها برای آزمایش واکسن روی مردم ما را نپذیرفت

    20 دی 1399
    روحانی: وزارت بهداشت به‌ درستی درخواست خارجی‌ها برای آزمایش واکسن روی مردم ما را نپذیرفت

    برخی از آراء دیوان عدالت اداری به دانشگاه و علم آسیب وارد می‌کند

    20 دی 1399
    برخی از آراء دیوان عدالت اداری به دانشگاه و علم آسیب وارد می‌کند

    توصیه‌های FATF برای همه کشورها جنبه الزامی دارد

    20 دی 1399
    توصیه‌های FATF برای همه کشورها جنبه الزامی دارد

    احتمال برداشته شدن محدودیت‌های کرونایی در انگلیس از فصل بهار

    18 آذر 1399
    احتمال برداشته شدن محدودیت‌های کرونایی در انگلیس از فصل بهار

    به جای صدور بخشنامه جلوگیری از زندان رفتن مردان، باید جلوی مهریه بالا گرفته شود

    3 آذر 1399
    به جای صدور بخشنامه جلوگیری از زندان رفتن مردان، باید جلوی مهریه بالا گرفته شود

    پارک‌ها و بوستان‌های تهران امروز تعطیل می‌شوند؟

    28 آبان 1399
    پارک‌ها و بوستان‌های تهران امروز تعطیل می‌شوند؟

    تعطیلی کامل شهرهای قرمز و مشکی ضروری است

    21 آبان 1399
    تعطیلی کامل شهرهای قرمز و مشکی ضروری است

    صعود مرگ‌های کرونایی در کشور/ وضعیت بیماری در ۳۱ استان

    18 آبان 1399
    صعود مرگ‌های کرونایی در کشور/ وضعیت بیماری در ۳۱ استان

    احتمال تعطیلی دو هفته‌ای تهران منتفی شده است

    18 آبان 1399
    احتمال تعطیلی دو هفته‌ای تهران منتفی شده است

    جریمه نیم میلیونی ۱۷ هزار خودرو به خاطر کرونا/ انصراف رانندگان ۴۰۰هزار خودرو از سفر

    18 آبان 1399
    جریمه نیم میلیونی ۱۷ هزار خودرو به خاطر کرونا/ انصراف رانندگان ۴۰۰هزار خودرو از سفر